考功司是吏部直接負責京察的部門，主要負責京察的具體工作，科道主要負責京察前一系列準備工作，及京察后的拾遺工作，對官員的考察結果最終“以聽上裁”，由皇帝決定被察官員的去留。
南京官員的考察“俱該南京吏部、都察院會同考察，徑自具題”，南京京官的考察不由北京部、院職掌，全權由南京部、院負責。
京察由吏部尚書主掌，吏部侍郎的職責為“主贊太宰”，協助吏部尚書工作，其職能貫穿京察的準備、進行和收尾的各個環節。
很不幸，今年發起的京察，或者成為閏察的主掌，就是剛剛回朝的武英殿大學士，吏部尚書高拱。
在楊博致仕后，隆慶皇帝并未讓內閣推舉新的吏部尚書，而是直接在旨意中讓高拱掌部。
這也是高拱在回朝后并沒有急于對一些人進行報復的原因，他有的是機會可以慢慢炮制一些人。
京察的準備階段，始于科道官的察前建言，隨后吏部堂官覆議科道官所陳言內容，并奏請開展京察的準備工作。
之后考語和訪單的填寫，是京察準備階段的重要工作，是部院進行堂審的主要依據。
吏部堂官命本部司官，制作應察官員名單，密托科道官共為咨訪，根據咨訪所得填寫訪單，再以回報堂官。
此外，各衙門堂官為屬官填寫的考語或者稱為考評，以及該自陳官員的自陳疏，皆由吏部堂官知會后進行收集。
而這些收集的文檔會被密封在吏部考功司，等候皇帝決定京察時間。
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